.03 Определение транскрибируемой цепи

Способ 1.
1) Если матричная цепь нижняя (смысловая цепь верхняя), то последовательность иРНК:
5'-ГУЦГЦАУГЦЦГГАУЦАУУЦГАГ-3';
2) открытая рамка считывания:
5'-АУГЦЦГГАУЦАУУЦГАГ-3' (или обозначена на иРНК);
3) данная рамка считывания не содержит кодонов, кодирующих аминокислоту арг (кодонов ЦГУ, ЦГЦ, ЦГА, ЦГГ, АГА или АГГ (кодоны указывать не обязательно);
4) если матричная цепь верхняя (смысловая цепь нижняя), то последовательность иРНК:
3'-ЦАГЦГУАЦГГЦЦУАГУААГЦУЦ-5'
ИЛИ
3'-ЦУЦГААУГАУЦЦГГЦАУГЦГАЦ-3';
5) открытая рамка считывания:
5'-АУГАУЦЦГГЦАУГЦГАЦ-3' (или обозначена на иРНК);
6) фрагмент полипептида: мет-иле-арг-гис-ала;
7) содержит аминокислоту арг (или выделена последовательности полипептида).

Способ 2.
1) Аминокислоте мет соответствует кодон 5'-АУГ-3' (АУГ) и, соответственно, триплет ДНК 5'-АТГ-3' (АТГ);
2) такой триплет присутствует в обеих цепях ДНК;
3) рамка считывания на верхней цепи ДНК:
5'-АТГЦЦГГАТЦАТТЦГАГ-3';
4) данная рамка считывания не содержит триплетов, кодирующих аминокислоту арг (ЦГТ, ЦГЦ, ЦГА, ЦГГ, АГА или АГГ; триплеты указывать не обязательно);
5) рамка считывания на нижней цепи ДНК:
3'-ЦАГЦГТАЦГГЦТАГТА-5'
ИЛИ
5'-АТГАТЦЦГГЦАТГЦГАЦ-3';
6) содержит триплет 5'-ЦГГ-3' (ЦГГ), кодирующий аминокислоту арг;
7) фрагмент полипептида: мет-иле-арг-гис-ала.